La Caisse possède son propre Code de déontologie.
L'objectif de ce code est de faire en sorte que la Caisse soit gérée conformément aux bonnes pratiques du secteur, aux principes éthiques fondamentaux d'honnêteté, d'intégrité, d'objectivité, d'équité et de compétence, et dans l'intérêt de ses membres et bénéficiaires.
Le CERN possède également un Code de conduite, qui s'applique à tous les membres de son personnel, aux consultants, au personnel d'entreprises contractantes ou aux personnes travaillant en quelque capacité que ce soit au CERN ou pour le compte du CERN.